MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Nitrosomonas sp. AL212 plasmid pNAL21202

Total Repeats: 217

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015221	T	6	6	2	7	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015221	TTA	2	6	11	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015221	ATA	2	6	33	38	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015221	ACAT	2	8	54	61	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_015221	CT	3	6	1669	1674	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_015221	A	6	6	1832	1837	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_015221	GCC	2	6	1855	1860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_015221	AGG	2	6	5192	5197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_015221	AGT	2	6	5298	5303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_015221	TGA	2	6	5604	5609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_015221	A	7	7	5653	5659	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_015221	AAG	2	6	5740	5745	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_015221	GAA	2	6	5773	5778	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_015221	TTAA	2	8	6022	6029	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_015221	CT	3	6	7923	7928	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_015221	CCT	2	6	15238	15243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_015221	GAT	2	6	15679	15684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_015221	TTG	2	6	15739	15744	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_015221	CAT	2	6	15879	15884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_015221	CCA	2	6	15969	15974	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_015221	GTT	2	6	16001	16006	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_015221	AAC	2	6	16010	16015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_015221	GTGTG	2	10	16035	16044	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
24	NC_015221	TCC	2	6	16088	16093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_015221	TAC	2	6	16169	16174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_015221	ATTCT	2	10	17244	17253	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_015221	CTT	2	6	17269	17274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_015221	ATGA	2	8	17338	17345	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_015221	TTAA	2	8	17351	17358	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_015221	ACC	2	6	17380	17385	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_015221	TAA	2	6	17424	17429	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_015221	T	6	6	17497	17502	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015221	G	6	6	17533	17538	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
34	NC_015221	ATG	2	6	17585	17590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_015221	GATT	2	8	17601	17608	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
36	NC_015221	TGA	2	6	17637	17642	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
37	NC_015221	TGT	2	6	17678	17683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_015221	GCA	2	6	17860	17865	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_015221	ATAA	2	8	17866	17873	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_015221	TAA	2	6	17895	17900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_015221	AT	3	6	17914	17919	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_015221	GAA	2	6	18628	18633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_015221	TAA	2	6	18640	18645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015221	TAA	2	6	18706	18711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015221	ATAAA	2	10	20149	20158	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015221	T	7	7	20172	20178	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015221	A	6	6	20363	20368	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015221	CTT	2	6	20464	20469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_015221	AAT	2	6	20492	20497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_015221	GGT	2	6	20510	20515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015221	ATA	2	6	20572	20577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015221	ATA	2	6	20592	20597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_015221	TTA	2	6	20603	20608	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_015221	ATA	2	6	20632	20637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_015221	GAAAT	2	10	20668	20677	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
56	NC_015221	CTG	2	6	20700	20705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_015221	CTT	2	6	20729	20734	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_015221	GAA	2	6	21403	21408	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_015221	T	6	6	21417	21422	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_015221	ATC	2	6	21473	21478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_015221	TAT	2	6	21677	21682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_015221	CAT	2	6	21707	21712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_015221	A	6	6	21719	21724	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_015221	AT	3	6	21754	21759	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_015221	TAT	2	6	21771	21776	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_015221	TCT	2	6	22845	22850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_015221	CAG	2	6	22855	22860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_015221	TCT	2	6	22926	22931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_015221	TGG	2	6	22957	22962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_015221	T	6	6	23020	23025	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_015221	CCTG	2	8	23070	23077	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_015221	AATA	2	8	23123	23130	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_015221	CCG	2	6	23224	23229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
74	NC_015221	ACC	2	6	23273	23278	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_015221	ATT	2	6	23354	23359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_015221	TTC	2	6	23378	23383	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_015221	AATA	2	8	23413	23420	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_015221	TA	3	6	23429	23434	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_015221	AGT	2	6	23437	23442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_015221	A	6	6	23932	23937	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_015221	A	7	7	23957	23963	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_015221	AT	3	6	23992	23997	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_015221	ACA	2	6	24017	24022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_015221	TA	3	6	24085	24090	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_015221	ACC	2	6	25289	25294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_015221	CG	3	6	25357	25362	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_015221	ACT	2	6	25450	25455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_015221	AAG	2	6	25480	25485	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_015221	AAAGC	2	10	25780	25789	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
90	NC_015221	A	6	6	25940	25945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_015221	AGTA	2	8	25998	26005	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_015221	T	7	7	26007	26013	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_015221	AAC	2	6	26033	26038	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_015221	A	6	6	26043	26048	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_015221	TAG	2	6	26052	26057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_015221	GTAAA	2	10	26068	26077	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
97	NC_015221	A	6	6	26075	26080	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_015221	TGT	2	6	26171	26176	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_015221	GTGA	2	8	26180	26187	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_015221	AGT	2	6	26201	26206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_015221	ATT	2	6	26287	26292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_015221	GT	3	6	26331	26336	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_015221	T	6	6	26384	26389	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_015221	ATTA	2	8	26440	26447	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_015221	AGA	2	6	26471	26476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_015221	T	6	6	26488	26493	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_015221	ATT	2	6	26494	26499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_015221	ATT	2	6	26508	26513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015221	TAT	2	6	26533	26538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015221	CAC	2	6	26563	26568	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_015221	GTT	2	6	26571	26576	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_015221	ACC	2	6	26591	26596	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
113	NC_015221	TG	3	6	26633	26638	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_015221	CCA	2	6	26647	26652	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_015221	ACC	2	6	26678	26683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_015221	AAT	2	6	26695	26700	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_015221	TTA	2	6	26704	26709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_015221	A	7	7	26737	26743	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_015221	TG	3	6	26748	26753	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_015221	CCA	2	6	26762	26767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_015221	ACT	3	9	26784	26792	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_015221	ACC	2	6	26816	26821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_015221	A	6	6	27964	27969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_015221	ATTA	2	8	29555	29562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_015221	GTTTA	2	10	29593	29602	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
126	NC_015221	TTAC	2	8	29606	29613	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_015221	TA	3	6	29632	29637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_015221	T	6	6	29655	29660	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015221	ATT	2	6	29675	29680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015221	AT	3	6	29687	29692	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_015221	TATT	2	8	29708	29715	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015221	ATA	2	6	29721	29726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_015221	TC	3	6	29727	29732	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_015221	AAAC	2	8	29737	29744	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_015221	A	6	6	29781	29786	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_015221	TCACA	2	10	29793	29802	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
137	NC_015221	AAT	2	6	29865	29870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_015221	ATT	2	6	30245	30250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_015221	CGC	2	6	38585	38590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_015221	TCA	2	6	38640	38645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_015221	AGAA	2	8	39789	39796	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
142	NC_015221	TGT	2	6	39800	39805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
143	NC_015221	T	6	6	39859	39864	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_015221	GAA	2	6	39880	39885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
145	NC_015221	ATC	2	6	39989	39994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_015221	AAGA	2	8	39997	40004	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_015221	TAT	2	6	40082	40087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_015221	TTA	2	6	40169	40174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_015221	GAA	2	6	40884	40889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
150	NC_015221	TTA	2	6	40908	40913	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_015221	TTTA	2	8	41419	41426	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_015221	T	7	7	41462	41468	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_015221	TGA	2	6	41479	41484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
154	NC_015221	CTTG	2	8	41537	41544	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
155	NC_015221	ACC	2	6	41608	41613	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
156	NC_015221	ACGA	2	8	41614	41621	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
157	NC_015221	T	6	6	41988	41993	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_015221	AAT	2	6	42815	42820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_015221	ATTA	2	8	42831	42838	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_015221	TTAT	2	8	42846	42853	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_015221	ATT	2	6	42856	42861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_015221	TGA	2	6	42889	42894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
163	NC_015221	ATC	2	6	42910	42915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
164	NC_015221	ATT	2	6	44503	44508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_015221	GAA	2	6	44513	44518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
166	NC_015221	A	6	6	44580	44585	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_015221	AATC	2	8	44587	44594	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
168	NC_015221	TAA	2	6	44673	44678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_015221	TTAT	2	8	44679	44686	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_015221	GGC	2	6	44731	44736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
171	NC_015221	A	6	6	44758	44763	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_015221	TA	3	6	45124	45129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_015221	TA	3	6	45171	45176	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_015221	ATA	2	6	45179	45184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
175	NC_015221	ACAGC	2	10	45189	45198	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
176	NC_015221	A	6	6	45245	45250	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
177	NC_015221	A	7	7	47913	47919	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_015221	TAATT	2	10	47935	47944	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_015221	TCT	2	6	47975	47980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
180	NC_015221	AGTG	2	8	48023	48030	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
181	NC_015221	GTTG	2	8	48039	48046	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
182	NC_015221	GCA	2	6	48127	48132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
183	NC_015221	CTT	3	9	48133	48141	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
184	NC_015221	CAT	2	6	48340	48345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
185	NC_015221	TCC	2	6	49628	49633	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
186	NC_015221	GCA	2	6	49687	49692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
187	NC_015221	TGC	2	6	49852	49857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
188	NC_015221	GTA	2	6	50050	50055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
189	NC_015221	AAG	2	6	50082	50087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
190	NC_015221	TGCT	2	8	50123	50130	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
191	NC_015221	TG	3	6	50156	50161	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
192	NC_015221	AC	3	6	50172	50177	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
193	NC_015221	ATT	3	9	50189	50197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
194	NC_015221	CCT	2	6	60112	60117	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
195	NC_015221	TTG	2	6	60121	60126	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
196	NC_015221	GTA	2	6	60196	60201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
197	NC_015221	T	8	8	60233	60240	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
198	NC_015221	A	7	7	60605	60611	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NC_015221	TAT	2	6	60648	60653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
200	NC_015221	A	6	6	60678	60683	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
201	NC_015221	ATA	2	6	61077	61082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
202	NC_015221	CAA	2	6	61098	61103	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
203	NC_015221	ATA	2	6	61108	61113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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216	NC_015221	CTA	2	6	63729	63734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
217	NC_015221	TAG	2	6	63755	63760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.